Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms