Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim59Q922Y2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms