Protein–RNA interactions for Protein: Q921W0

Chmp1a, Charged multivesicular body protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1aQ921W0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1aQ921W0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms