Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Odf3Q920N1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Odf3Q920N1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Odf3Q920N1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Odf3Q920N1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Odf3Q920N1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Odf3Q920N1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Odf3Q920N1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf3Q920N1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Odf3Q920N1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Odf3Q920N1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Odf3Q920N1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Odf3Q920N1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Odf3Q920N1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Odf3Q920N1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Odf3Q920N1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Odf3Q920N1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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