Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarca5Q91ZW3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms