Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp3Q91W36 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms