Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc71Q8VEG0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms