Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC82

Rhbdl1, Rhomboid-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl1Q8VC82 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl1Q8VC82 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl1Q8VC82 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl1Q8VC82 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms