Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBX6

Mpdz, Multiple PDZ domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MpdzQ8VBX6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms