Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OptnQ8K3K8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms