Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd2Q8K2Z4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms