Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf39Q8K2Z2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms