Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FgbQ8K0E8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms