Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrit1Q8K099 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrit1Q8K099 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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