Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pnma3Q8JZW8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pnma3Q8JZW8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms