Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf628Q8CJ78 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms