Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms