Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Atg4aQ8C9S8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Atg4aQ8C9S8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg4aQ8C9S8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg4aQ8C9S8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg4aQ8C9S8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Atg4aQ8C9S8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Atg4aQ8C9S8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Atg4aQ8C9S8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Atg4aQ8C9S8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Atg4aQ8C9S8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Atg4aQ8C9S8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Atg4aQ8C9S8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Atg4aQ8C9S8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Atg4aQ8C9S8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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