Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc60Q8C4J0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc60Q8C4J0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc60Q8C4J0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc60Q8C4J0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc60Q8C4J0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc60Q8C4J0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc60Q8C4J0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc60Q8C4J0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc60Q8C4J0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc60Q8C4J0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc60Q8C4J0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc60Q8C4J0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc60Q8C4J0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc60Q8C4J0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc60Q8C4J0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc60Q8C4J0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms