Protein–RNA interactions for Protein: Q8C165

Pm20d1, N-fatty-acyl-amino acid synthase/hydrolase PM20D1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d1Q8C165 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pm20d1Q8C165 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pm20d1Q8C165 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pm20d1Q8C165 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pm20d1Q8C165 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pm20d1Q8C165 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pm20d1Q8C165 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pm20d1Q8C165 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pm20d1Q8C165 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pm20d1Q8C165 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pm20d1Q8C165 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pm20d1Q8C165 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pm20d1Q8C165 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pm20d1Q8C165 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pm20d1Q8C165 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pm20d1Q8C165 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pm20d1Q8C165 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms