Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm4aQ8BW72 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kdm4aQ8BW72 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms