Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
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Usp38Q8BW70 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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Usp38Q8BW70 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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Usp38Q8BW70 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp38Q8BW70 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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