Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU27

Ppm1m, Protein phosphatase 1M, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1mQ8BU27 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppm1mQ8BU27 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppm1mQ8BU27 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms