Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJW5

Nol11, Nucleolar protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol11Q8BJW5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nol11Q8BJW5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nol11Q8BJW5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms