Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms