Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdca8Q8BHX3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdca8Q8BHX3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdca8Q8BHX3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdca8Q8BHX3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdca8Q8BHX3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdca8Q8BHX3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdca8Q8BHX3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdca8Q8BHX3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdca8Q8BHX3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdca8Q8BHX3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdca8Q8BHX3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdca8Q8BHX3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdca8Q8BHX3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdca8Q8BHX3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdca8Q8BHX3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdca8Q8BHX3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdca8Q8BHX3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdca8Q8BHX3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdca8Q8BHX3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdca8Q8BHX3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdca8Q8BHX3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdca8Q8BHX3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdca8Q8BHX3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms