Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms