Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4dQ8BGV9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.8 ms