Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms