Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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