Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M10.4Q85ZW8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M10.4Q85ZW8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M10.4Q85ZW8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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H2-M10.4Q85ZW8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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H2-M10.4Q85ZW8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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H2-M10.4Q85ZW8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M10.4Q85ZW8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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H2-M10.4Q85ZW8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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H2-M10.4Q85ZW8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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H2-M10.4Q85ZW8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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