Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc50Q810U5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms