Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ttc28Q80XJ3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc28Q80XJ3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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