Protein–RNA interactions for Protein: Q80WM4

Hapln4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln4Q80WM4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hapln4Q80WM4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms