Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc155Q80VJ8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc155Q80VJ8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc155Q80VJ8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms