Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atf7ipQ7TT18 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf7ipQ7TT18 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms