Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Actn1Q7TPR4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Actn1Q7TPR4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Actn1Q7TPR4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Actn1Q7TPR4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Actn1Q7TPR4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Actn1Q7TPR4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Actn1Q7TPR4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Actn1Q7TPR4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Actn1Q7TPR4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Actn1Q7TPR4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Actn1Q7TPR4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Actn1Q7TPR4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Actn1Q7TPR4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Actn1Q7TPR4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Actn1Q7TPR4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Actn1Q7TPR4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Actn1Q7TPR4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Actn1Q7TPR4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Actn1Q7TPR4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Actn1Q7TPR4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Actn1Q7TPR4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Actn1Q7TPR4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Actn1Q7TPR4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Actn1Q7TPR4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Actn1Q7TPR4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Actn1Q7TPR4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Actn1Q7TPR4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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