Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Eci3Q78JN3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms