Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms