Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms