Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms