Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf1cQ6PDZ2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf1cQ6PDZ2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms