Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms