Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gapvd1Q6PAR5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gapvd1Q6PAR5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gapvd1Q6PAR5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gapvd1Q6PAR5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gapvd1Q6PAR5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gapvd1Q6PAR5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gapvd1Q6PAR5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gapvd1Q6PAR5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gapvd1Q6PAR5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gapvd1Q6PAR5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gapvd1Q6PAR5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gapvd1Q6PAR5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gapvd1Q6PAR5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gapvd1Q6PAR5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gapvd1Q6PAR5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gapvd1Q6PAR5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gapvd1Q6PAR5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gapvd1Q6PAR5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gapvd1Q6PAR5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Gapvd1Q6PAR5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gapvd1Q6PAR5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms