Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Z1

Smarcd3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd3Q6P9Z1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd3Q6P9Z1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcd3Q6P9Z1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcd3Q6P9Z1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcd3Q6P9Z1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcd3Q6P9Z1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcd3Q6P9Z1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcd3Q6P9Z1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcd3Q6P9Z1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd3Q6P9Z1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms