Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc148Q6P5U8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms