Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smchd1Q6P5D8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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