Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T2

Snrnp200, U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp200Q6P4T2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp200Q6P4T2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp200Q6P4T2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms