Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdm2bQ6P1G2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms