Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E8

Efcab6, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab6Q6P1E8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcab6Q6P1E8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms